Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms