Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SFTPDP35247 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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SFTPDP35247 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SFTPDP35247 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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