Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB9P28065 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms