Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APEX1P27695 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
APEX1P27695 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APEX1P27695 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
APEX1P27695 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
APEX1P27695 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APEX1P27695 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APEX1P27695 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APEX1P27695 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APEX1P27695 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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APEX1P27695 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
APEX1P27695 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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