Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
IL3RAP26951 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
IL3RAP26951 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms