Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CD247P20963 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CD247P20963 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CD247P20963 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms