Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
POLR2CP19387 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms