Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCP1P17987 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TCP1P17987 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms