Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NR2F1P10589 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms