Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTNSO60931 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTNSO60931 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CTNSO60931 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CTNSO60931 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTNSO60931 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms