Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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PRAMEF10O60809 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PRAMEF10O60809 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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