Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGEF9O43307 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms