Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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