Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HHLA1C9JL84 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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