Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD8B2A6NJW9 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms