Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC78A2IDD5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms