Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
APEX2Q9UBZ4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms