Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GDE1Q9NZC3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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