Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNK4Q9NYG8 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNK4Q9NYG8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms