Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PI4K2AQ9BTU6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PI4K2AQ9BTU6 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms