Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
C2orf88Q9BSF0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms