Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
NIPSNAP1Q9BPW8 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms