Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPS6KC1Q96S38 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPS6KC1Q96S38 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms