Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
C9orf85Q96MD7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms