Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCARF2Q96GP6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms