Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ELP4Q96EB1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ELP4Q96EB1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms