Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EFHD2Q96C19 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms