Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RNF34Q969K3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RNF34Q969K3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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