Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RPL3LQ92901 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RPL3LQ92901 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms