Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
REEP3Q6NUK4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms