Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NANOGP8Q6NSW7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NANOGP8Q6NSW7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms