Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP3

MLIP, Muscular LMNA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLIPQ5VWP3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MLIPQ5VWP3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MLIPQ5VWP3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms