Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAB6CQ53S08 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms