Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCDC153Q494R4 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms