Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CDO1Q16878 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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