Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SEC23BQ15437 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SEC23BQ15437 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms