Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NEUROD1Q13562 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
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