Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHAF1AQ13111 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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CHAF1AQ13111 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CHAF1AQ13111 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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