Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CD300CQ08708 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CD300CQ08708 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms