Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SRSF4Q08170 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms