Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CENPCQ03188 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CENPCQ03188 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms