Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CBX1P83916 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBX1P83916 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms