Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPC3P51654 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPC3P51654 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms