Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB28P51157 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB28P51157 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms