Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CLK1P49759 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLK1P49759 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms