Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FNTAP49354 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FNTAP49354 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FNTAP49354 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms