Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GNPDA1P46926 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms