Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASQ1P31415 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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