Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXA7P31268 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms