Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
POLD1P28340 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
POLD1P28340 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms